Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai2Q9QVY8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai2Q9QVY8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rai2Q9QVY8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai2Q9QVY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms