Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Reep6Q9JM62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Reep6Q9JM62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep6Q9JM62 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Reep6Q9JM62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Reep6Q9JM62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms