Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cul3Q9JLV5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul3Q9JLV5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul3Q9JLV5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul3Q9JLV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms