Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msrb1Q9JLC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msrb1Q9JLC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msrb1Q9JLC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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