Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb1Q9JIF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copb1Q9JIF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb1Q9JIF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb1Q9JIF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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