Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2ird1Q9JI57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird1Q9JI57 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2ird1Q9JI57 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms