Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW2

Nit2, Omega-amidase NIT2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nit2Q9JHW2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nit2Q9JHW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nit2Q9JHW2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nit2Q9JHW2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nit2Q9JHW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nit2Q9JHW2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms