Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snap29Q9ERB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap29Q9ERB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap29Q9ERB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snap29Q9ERB0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms