Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf21Q9EPU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf21Q9EPU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms