Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xab2Q9DCD2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xab2Q9DCD2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xab2Q9DCD2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xab2Q9DCD2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xab2Q9DCD2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms