Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne8Q9DC53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpne8Q9DC53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne8Q9DC53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cpne8Q9DC53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms