Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp2aQ9DB34 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp2aQ9DB34 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp2aQ9DB34 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp2aQ9DB34 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2aQ9DB34 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms