Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PacrgQ9DAK2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PacrgQ9DAK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PacrgQ9DAK2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PacrgQ9DAK2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms