Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp12Q9D9M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp12Q9D9M2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp12Q9D9M2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp12Q9D9M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp12Q9D9M2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms