Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms