Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx5Q9D8U8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx5Q9D8U8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Snx5Q9D8U8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx5Q9D8U8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms