Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SlirpQ9D8T7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SlirpQ9D8T7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlirpQ9D8T7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SlirpQ9D8T7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.3 ms