Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo2Q9D8S4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo2Q9D8S4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo2Q9D8S4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo2Q9D8S4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms