Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syap1Q9D5V6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syap1Q9D5V6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syap1Q9D5V6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syap1Q9D5V6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms