Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gcc1Q9D4H2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gcc1Q9D4H2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Gcc1Q9D4H2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcc1Q9D4H2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcc1Q9D4H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms