Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necap2Q9D1J1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Necap2Q9D1J1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Necap2Q9D1J1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Necap2Q9D1J1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms