Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Twist2Q9D030 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms