Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Thumpd2Q9CZB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Thumpd2Q9CZB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thumpd2Q9CZB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Thumpd2Q9CZB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms