Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp2Q9CYZ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms