Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RpainQ9CWY9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RpainQ9CWY9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RpainQ9CWY9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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