Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smc3Q9CW03 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smc3Q9CW03 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Smc3Q9CW03 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smc3Q9CW03 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smc3Q9CW03 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms