Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms