Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EcdQ9CS74 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EcdQ9CS74 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EcdQ9CS74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EcdQ9CS74 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EcdQ9CS74 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms