Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gnpda2Q9CRC9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gnpda2Q9CRC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnpda2Q9CRC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms