Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930519G04RikQ9CPT7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930519G04RikQ9CPT7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930519G04RikQ9CPT7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930519G04RikQ9CPT7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930519G04RikQ9CPT7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms