Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GpnmbQ99P91 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GpnmbQ99P91 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GpnmbQ99P91 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GpnmbQ99P91 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GpnmbQ99P91 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms