Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trem2Q99NH8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trem2Q99NH8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trem2Q99NH8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem2Q99NH8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms