Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms