Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcbtb2Q99LJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Rcbtb2Q99LJ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rcbtb2Q99LJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms