Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds2Q99L43 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds2Q99L43 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cds2Q99L43 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds2Q99L43 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms