Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SptssbQ925E8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SptssbQ925E8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SptssbQ925E8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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