Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbox1Q924Y0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bbox1Q924Y0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Bbox1Q924Y0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbox1Q924Y0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bbox1Q924Y0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbox1Q924Y0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms