Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim59Q922Y2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim59Q922Y2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim59Q922Y2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim59Q922Y2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim59Q922Y2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim59Q922Y2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim59Q922Y2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim59Q922Y2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim59Q922Y2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim59Q922Y2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim59Q922Y2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms