Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Grin3bQ91ZU9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Grin3bQ91ZU9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Grin3bQ91ZU9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Grin3bQ91ZU9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Grin3bQ91ZU9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,4 ms