Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek8Q91ZR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek8Q91ZR4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek8Q91ZR4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek8Q91ZR4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek8Q91ZR4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms