Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Basp1Q91XV3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Basp1Q91XV3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Basp1Q91XV3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Basp1Q91XV3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Basp1Q91XV3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms