Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubl7Q91W67 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl7Q91W67 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl7Q91W67 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubl7Q91W67 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl7Q91W67 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms