Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn8Q91VA3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn8Q91VA3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn8Q91VA3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms