Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApofQ91V80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApofQ91V80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ApofQ91V80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ApofQ91V80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms