Protein–RNA interactions for Protein: Q91V57

Chn1, N-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn1Q91V57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chn1Q91V57 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chn1Q91V57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chn1Q91V57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn1Q91V57 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chn1Q91V57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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