Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9aQ8VDU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9aQ8VDU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9aQ8VDU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9aQ8VDU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apol9aQ8VDU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9aQ8VDU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apol9aQ8VDU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol9aQ8VDU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms