Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fyco1Q8VDC1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fyco1Q8VDC1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fyco1Q8VDC1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Fyco1Q8VDC1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Fyco1Q8VDC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Fyco1Q8VDC1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Fyco1Q8VDC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms