Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SdsQ8VBT2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SdsQ8VBT2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SdsQ8VBT2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SdsQ8VBT2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SdsQ8VBT2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SdsQ8VBT2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SdsQ8VBT2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SdsQ8VBT2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SdsQ8VBT2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SdsQ8VBT2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SdsQ8VBT2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms