Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip5Q8R361 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip5Q8R361 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip5Q8R361 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms