Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2P1

Klhl25, Kelch-like protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl25Q8R2P1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms