Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc5Q8K4Z2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc5Q8K4Z2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc5Q8K4Z2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc5Q8K4Z2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc5Q8K4Z2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms